尿道结石绝大多数为继发性因素引起，原发性结石很少，常见男性前列腺结石，通常前列腺结石不会引起症状，也无需特殊处理。继发性的原因包括肾脏结石、输尿管结石及膀胱结石碎石术后，部分结石排出过程中受阻，停留在尿道内便形成尿道结石。另外，还可见于后尿路梗阻的患者，如尿道狭窄和前列腺增生的患者排尿不畅，导致尿液长期残留于尿道及膀胱内，久而久之便形成膀胱结石或尿道结石，在排尿过程中，结石随着尿液向前运动时，停留于尿道的狭窄部位，便形成了尿道结石。慢性尿路感染也可能形成膀胱结石和尿道结石，感染致使尿液混浊，有形成分沉淀，形成尿道结石。