小便时尿道口有疼痛感需要根据具体病因进行针对性的治疗。如果是性生活过度摩擦刺激导致的，就需要多喝水多排尿，并且短期内要禁止性生活，减少对尿道口的刺激。如果是包皮垢刺激尿道口引起的炎症反应，就需要及时进行消炎治疗，同时用高锰酸钾溶液进行冲洗。如果有包皮过长或者是包茎，最好及时到医院做包皮环切手术治疗。如果是尿道结石引起的尿道口疼痛，就需要及时到医院进行取石治疗。通过正规治疗以后就可以缓解小便时尿道口疼痛的症状，并且定期去医院进行复查。