甲状腺球蛋白是一种潜在的自身抗原，当进入血液后可刺激机体产生甲状腺球蛋白抗体，甲状腺球蛋白抗体的测定有助于甲状腺疾病的病因分类及判断预后、有助于诊断自身免疫疾病，在自身免疫性甲状腺炎患者可发现甲状腺球蛋白抗体浓度增高，出现频率大约是70~%-80%；亦可见于其他甲状腺疾病（Graver病、甲状腺癌等）。对于甲状腺球蛋白抗体的增高要查明病因，针对病因进行治疗。