胃肠神经功能紊乱可以吃的药物包括一些调节神经功能、改善睡眠的药物，以及治疗肠道的神经功能失调的药物，和用于治疗肠道功能紊乱的药物。比如可以酌情的使用马来酸曲美布汀，它可以用于治疗菌群失调所导致的肠功能紊乱，也可以使用复方谷氨酰胺肠溶胶囊，它可以用来治疗各种原因所导致的急性和慢性肠道疾病和肠功能紊乱，以及一些放疗化疗所导致的肠炎。也可以使用匹维溴铵，它可以对症治疗，以及治疗肠道功能紊乱有关的疼痛、排便异常和肠道不适等等症状。