子宫内膜异位症的主要症状有疼痛、不孕、月经异常。子宫内膜异位症是指内膜出现在女性子宫体以外的位置，疼痛是主要症状，部位多在下腹、腰骶、盆腔中部，有时会阴部、肛门和大腿处也会出现疼痛，经期加重，有痛经现象，约40%的患者会导致不孕，也有患者会出现月经量增多、经期延长、月经淋漓不尽的情况。但当子宫内膜异位症出现在盆腔外部位时，也会有特殊的症状，如在肠道时，有腹痛、腹泻、便秘或周期性少量便血的情况；在膀胱时，出现尿痛和尿频；输尿管时，出现腰痛和血尿现象。