药物治疗需在医生的指导下，根据患儿的临床表现及其与进餐的关系，可选用促动力药，抗酸药，抑酸药及肠道益生菌等药物治疗，一般疗程2～4周。幽门螺旋菌感染患儿建议进行根除幽门螺旋菌的治疗，中药治疗也是功能性胃肠病的一种良好的治疗方法。小儿消化不良，易称功能性消化不良，是一组以反复发作的餐后腹胀、厌食、嗳气、恶心、呕吐，上腹痛、上腹烧灼感或反酸为主要表现，经各项检查，排除器质性，系统性或代谢性疾病的常见临床症候群。疾病的非药物治疗包括调节饮食，改变排便习惯及认知治疗，建议少吃高脂食物，冷饮，碳酸饮料，零食及不消化的食物，养成良好的进餐习惯，不要过饱，按时进餐。多吃蔬菜、水果是调整消化的好方法。教育儿童养成良好的排便习惯，使排便正常化，有助于改善消化不良症状。