在临床上治疗肌肉萎缩，最好的办法是针对病因治疗，但是不同病因引起来的肌肉萎缩治疗的方法是有所不同的。比如如果患者是由于长期的周围神经病变导致的肌肉萎缩，这种情况就要给予积极的营养神经治疗，同时给予康复锻炼这样才还能够避免肌肉萎缩的恶化。如果患者是肌炎引起来的肌肉萎缩，那么像这种情况就需要尽早地给予免疫抑制剂治疗，避免肌肉萎缩的进展。另外如果患者是由于运动神经元病导致的肌肉萎缩，那么只有控制运动神经元病，肌肉萎缩的病情才能够得到有效控制。