肝内胆管结石和胆囊结石，在治疗上的区别主要如下：肝内胆管结石，在数量单发、体积较小，不引起明显临床症状的情况下，可以不用进行治疗。胆囊内的结石，已经明确诊断，原则上来说都应该及时进行手术治疗。肝内胆管结石数量较多、体积较大，引起胆汁淤积现象，需要进行手术治疗时，一般都行胆管切开取石手术，比较严重的患者很有可能需要进行肝叶或者肝段切除手术。胆囊结石患者的手术治疗，一般以保胆取石手术或者胆囊摘除手术为主，通常不会涉及肝脏。