动车台州站和台州西站是两个不同的火车站，它们之间的区别如下：

1.位置：动车台州站位于台州市区中心，距离市中心约4公里，交通便利；而台州西站位于台州市西部，距离市中心较远，需要乘坐公共交通工具或出租车前往。

2.车站规模：动车台州站是一个较大的火车站，设有多个站台和候车室，可容纳更多的旅客；而台州西站规模较小，设施相对简单。

3.发车方向：动车台州站主要发往南方城市，如广州、深圳、福州等；而台州西站主要发往西部城市，如成都、重庆等。

4.车次数量：动车台州站车次较多，可供选择的车次更多；而台州西站车次相对较少。

综上所述，动车台州站和台州西站在位置、规模、发车方向和车次数量等方面存在差异，旅客可以根据自己的出行需求选择适合自己的车站。