肛门里面疼痛可能是肛管炎、肛隐窝炎，也可能是肛门粘膜下脓肿引起的疼痛。这种情况下应该尽早去医院的肛肠外科做肛门指检或者是肛门镜的检查，同时抽血检查血常规，看看白细胞以及中性粒细胞、C反应蛋白情况，是否存在明显的感染。如果是肛管炎或者是肛窦炎，一般可以选择甲硝唑栓或者是甲硝唑注射液进行肛门给药治疗，同时饮食方面注意清淡，多吃些清热解毒的食物，比如金银花、绿豆。同时多饮水，保持排便的顺畅，排便后选择肛门洗剂进行坐浴。但是如果是肛门粘膜下脓肿，则需要采取手术切开引流，或者是做肛周脓肿一次性根治术，以免感染进一步加重，诱发肛瘘。