盐酸帕罗西汀作为选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，副作用比较少，目前已经发现的副作用有胃肠道反应，比如恶心、呕吐、口干、口苦、腹泻、便秘等，这些胃肠道反应主要是刚开始服药期间比较多见，尤其是刚开始服药的第一个星期内，以后可以慢慢消失。还有一些其它的副作用，比如头晕、睡眠过多或者加重焦虑等等，也有转为躁狂的可能性，因为这种抗抑郁药物对于有双相倾向的患者，可能会诱发躁狂发作，比如兴奋话多或者情感高涨、意志活动增强等等。长期服用还需要考虑对于肝肾功能的损害，尤其是服药3个月以上一定要定期检查肝肾功能，以免出现肝肾功能的异常。