肝素钠和肝素钙二者都属于抗凝血药以及溶栓类的药物，主要在药理毒理、药代动力学以及适应症、用法用量、不良反应、禁忌症等，几个方面都有一些区别。简而言之肝素钙和肝素钠的作用相似，但是肝素钙皮下注射以后不减少细胞间毛细血管的钙胶质，也不改变血管通透性。基本上克服了肝素钠皮下注射容易导致出血的副作用，此外肝素钙还具有明显的抗肾素和抗醛固酮的活性作用。