HPV病毒阳性的时候，可以用以下的药物进行治疗。一、可以使用干扰素胶囊进行治疗，干扰素胶囊塞入患者的阴道内，同时还可以起到抗病毒的作用，提高患者的免疫力。第二，可以用保妇康栓，也能够起到消炎和抗病毒类的治疗，这类药物可以治疗HPV病毒感染的患者，还能够修复患者的阴道，使患者阴道的内环境恢复正常。三，患者还能够通过使用瑞贝生，提高患者身体的免疫力，药物适用于感染HPV病毒后，抵抗力比较差的患者。因此，提高患者自身免疫力，是治疗HPV病毒最好的方法。