奥利司他副作用发生率具有个体的差异，临床研究表明，奥利司他副作用有以下几种，奥利司主要引起胃肠道不良反应，常见的不良反应有油性斑点、肠道排气增加、大便紧迫感、脂肪性状的大便或者说是油性的大便、脂肪泻、大便次数明显增多，严重者可以引起大便不受控制；第二可以出现一些急性的胃肠道反应，比如在用药以后出现腹痛、腹胀、水样大便、、直肠疼痛；第三其他少见的不良事件有上呼吸道感染、流行性感冒、月经失调、失眠、焦虑、疲乏、泌尿道感染等。