慢性肠胃炎的症状缺乏特异性，尤其是在早期的时候。慢性肠胃炎患者主要临床表现为食欲减退，进食中或者进食后腹部疼痛，或者腹部为无规律性的疼痛，还可伴有嗳气、恶心、腹胀、呕吐、腹泻、里急后重、黏液脓血便以及消化不良等。有些病人还可能会出现消瘦、贫血、营养不良的表现，个别的患者可能会有呕血、黑便。这往往与幽门螺旋杆菌感染有关，也可能和长期大量饮酒、口服非甾体类的抗炎药、饮食不规律、饮食不健康、自身免疫等因素有一定的关系。一般较准确的诊断方法是胃肠镜的检查。