脑囊虫治疗分为：1.药物治疗，使用广谱抗囊虫药物治疗，为了减免抗囊虫药物治疗过程中体内出现过敏反应，药物治疗一般从小剂量开始，逐渐加量，在出现颅内压增高情况下，可酌情使用类固醇激素等，如果发生严重颅内压增高，要停用抗囊虫药物，配合脱水，抗过敏治疗。2.手术治疗，确诊为脑室型脑囊虫病患者应手术治疗。此外，颅内压持续增高，神经体征及颅脑CT证实病灶比较局限患者，可考虑手术治疗。3.驱绦虫治疗，对肠道仍有绦虫寄生者，为防止自身再次感染，应使用抗绦虫药物进行治疗。预防脑囊虫病主要是不吃生菜，生肉。