正常人每日3餐后约有9L水进入机体，大多数经过肠道被吸收，粪便中仅有100-200ml水，所以水样便一般是因为摄入过多或者肠道病变引起，可见于多种疾病。主要由于感染因素导致：细菌、病毒、真菌等感染；霍乱弧菌感染导致的腹泻也为大量水样便、艾滋病患者并发肠道隐孢子虫感染时可出现大量稀水样大便、秋季小儿轮状病毒感染也表现为稀水样便；此外水样便还可见于一些非感染性因素导致：如炎症性肠病、部分自身免疫性肠病、肿瘤及放射物质导致等。