骨髓空洞症的治疗方法包括以下几种：第一、病灶清除术，切除窦道、摘除死骨、刮除肉芽，伤口内留置凡士林纱布，隔日换药一次，直至伤口愈合；第二、肌瓣填塞术，于摘除死骨后腔洞内置以有血运之肌瓣及抗生素后缝合伤口，较常用于股骨和肱骨；第三、骨部分切除术，在累及某些不影响功能的骨骼时可切除病灶骨骼，适用于肋骨、腓骨及髂骨翼等；第四、截肢术，在有癌变时应做截肢手术，对不重要的足趾或手指，为挽救其他手指及足趾功能，可做截指（趾）术。