阿米巴痢疾最常见的肠道病变部位是在肌肉层，主要是在回盲部，升级成其次，是降结肠，乙状结肠。还可以出现阑尾、盲肠的病变，主要是溃疡的病变，溃疡的特点，呈口小底大的烧瓶状。有些严重的会合并肠出血，肠穿孔，有些可能会出现阿米巴的肠外转移，出现阿米巴肝脓肿，需要结合实际情况来进行处理，首选甲硝唑来进行抗感染治疗，还需要保持肠道的通畅。