治疗肠胃炎的药主要以抗菌药物为主，如头孢类抗生素、喹诺酮类抗生素等，这主要是由于胃肠炎的患者通常是由于细菌感染所引起，，可以使用抗生素来进行治疗，另外胃肠炎患者还可以使用其他药物来进行对症治疗，如出现腹痛可以使用促进动力的药物如多潘立酮片等，如果出现腹泻还可以使用止泻药物如蒙脱石散等。另外胃肠炎患者如果有幽门螺旋杆菌感染，还可以使用抗幽门螺旋杆菌感染进行根治。