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肾囊肿可以由很多原因引起:1、先天遗传因素是肾囊肿最常见的原因之一;2、基因突变也引起肾囊肿的发病原因之一;3、各种中毒对肾脏的损伤,例如常见的毒物,有农药、化学制剂、放射线、污染等等;4、有些感染的原因产生了有利于肾囊肿基因变化的因素,也可引起肾囊肿;5、现代医学研究证明,不良的情绪变化也是诱发肾囊肿发生的因素之一。