慢性肾萎缩也就提示是一个慢性病变的过程，往往都是不可逆的，对于它的治疗主要是对症治疗为主。另外对于双侧肾萎缩往往是由于慢性的肾脏疾病导致的，除了肾脏超声发现肾脏萎缩的情况。另外抽血化验还可能会发现血肌酐水平的升高，慢性肾萎缩往往和慢性肾衰竭、尿毒症是相辅相成的、相互影响。如果说是双侧的肾萎缩，那么这个时候主要是以控制血压、延缓肾功能恶化为目的，达到替代治疗的阶段以后选择合理的替代治疗方式，比如血液透析、腹膜透析或者是肾移植，同时纠正贫血，调节钙磷的代谢。