合同纠纷三年后会失效，合同纠纷属于民事纠纷，有三年诉讼时效的限制，从权利人知道自己的合法权益受侵害之日开始计算。解决合同纠纷的方式有很多，当事人能够达成一致意见的，可以自行和解；无法达成一致意见的，也可以申请仲裁。