治疗幽门螺旋杆菌通常是以PPI或者铋剂为基础，同时再加上一种或者两种抗生素联合治疗可以有效的根除幽门螺旋杆菌。如果治疗效果欠佳，必要时需要更换抗生素，有可能是对药物耐药或者不规律的用药引起。如果按时按量坚持治疗，大部分都可以转阴，并且可以达到根除的目的，尽可能的预防复发。期间还需要观察是否有明显的上腹部不适等消化不良表现，有溃疡者需要在根除治疗后结合抗溃疡治疗。