紧急避孕药和短效避孕药虽然临床上都可以起到避孕作用，但是它们还是有一定区别的。首先，它们的成分不同，短效避孕药是低量的雌孕激素合剂，可以抑制排卵，抑制输卵管的蠕动，阻止受精卵的着床等而起到避孕的作用，而紧急避孕药主要的成分是高效的孕激素，它主要是改变子宫内膜的状态而阻止受精卵的着床而起到避孕作用。其次，紧急避孕药和短效避孕药避孕的效果不同，短效避孕药可以达到几乎100%的避孕率，而短效避孕药只能达到80%左右的避孕率。最后，两种避孕药的副作用不同，短效避孕药，因为是低量或者微量的雌孕性激素，对身体内分泌的影响较小，甚至可以用于调整月经周期的治疗，而紧急避孕药因为高效的孕激素可能会干扰体内的雌孕激素规律性的变化，反复的使用很可能会导致月经失调，所以如果需要避孕，最好建议选择短效避孕药。