屁眼里面疼痛的话，那么可能性比较大的是直肠内的炎症或者是有肛窦的发炎，另外就得排除是不是有直肠粘膜下脓肿的情况。如果是直肠炎或者是肛窦发炎，可以通过肛门镜或者是电子大肠镜的检查来明确诊断，同时也要结合病理的检查结果，如果是直肠黏膜下的脓肿，可以通过肛门的指检，直肠内超声检查以及肛周核磁共振的检查来进行确诊。在诊断明确以后都要及时的进行治疗，避免症状进一步的加重。如果是存在肠道内的炎症，是以保守治疗为主，如果是有脓肿的发生，那么需要通过手术进行治疗。