龟头扁平苔藓可以选择局部用药、系统用药等方式治疗。首先，是局部用药方面。可选择糖皮质激素类，常见的比如地奈德乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等，还可以选择外用维甲酸类药物，常见的包括维A酸乳膏、他扎罗汀凝胶等，也可以选择外用钙调磷酸酶抑制剂。其次，是系统用药方面，严重者可系统使用免疫抑制剂，常见的比如甲氨蝶呤、硫唑嘌呤等，也可以系统使用维甲酸类药物，常见的比如阿维A等。龟头扁平苔藓应注意与龟头炎相鉴别。