小儿病毒性口腔疱疹的治疗，主要包括一般治疗，主要是要多休息、多饮水，进行呼吸道隔离治疗以及对症治疗，如高热可以口服解热镇痛药，如对乙酰氨基酚或布洛芬等；咽痛可以含服咽喉片，也可以喷开喉剑气雾剂，以及吃清热解毒的中成药，如蓝芩口服液或者喉咽清口服液等；抗病毒药可以选用利巴韦林口服，病情重的需要到医院去输液治疗或者住院治疗。如果合并有细菌感染，则可以用抗生素治疗，疗程大概需要一周。