猫眼睛颜色不同的原因是出于品种的不同，或同一品种中个体的猫对色素的吸收和储存的能力不一样。不同颜色的色素沉积在各种猫的眼底视网膜上，使它们视网膜上颜色各异。我们所看到的猫眼睛的颜色，其实就是透过透明的角膜看到的猫眼底视网膜上的颜色。色素在视网膜与在皮肤毛囊内的沉积有一定相关性。