明确原因，针对病因治疗咳嗽需要及时前往呼吸科进行病因的诊治，再予以规范的处理或是治疗。例如怀疑为咳嗽变异性哮喘时完善胸片、呼出气一氧化氮测定，明确诊断以后予以吸入性的糖皮质激素治疗。某些下呼吸道感染性疾病亦可引起长时间的咳嗽，特别是肺结核患者，此时则需要完善胸片、相应的病原学检测，有时还需要联合支气管镜的检查，肺结核患者则需要予以抗结核以及止咳等对症处理。某些肺癌患者亦可以引起长时间的咳嗽，患者多需要完善胸部CT、支气管镜或者是经皮肺穿刺的病理活检等，肺癌引起的长时间咳嗽，则需要抗肿瘤以及止咳等综合的对症处理。某些慢性呼吸系统疾病亦可以引起长时间的咳嗽，例如慢支、支气管扩张，此时亦需要根据病情给予以对症的处理。