肛门长水泡、疼痛，常见于血栓性外痔、肛周湿疹或者是生殖器疱疹。肛门长水泡、疼痛是比较常见的情况，考虑主要由上述三种原因导致。如果水泡呈暗紫色或者是红色、周围胀痛，多是由于长时间便秘或者是肛周静脉曲张引起的血栓外痔。如果肛门周围起水泡以及生殖器周围也有水泡，这种情况多见于生殖器疱疹。如果肛门周围起水泡呈对称性，则一般见于肛周湿疹。不同的情况需要采取不同的治疗方式，比如针对生殖器疱疹，需要使用抗病毒药物治疗。