艾滋病晚期，由于艾滋病病毒的大量复制，会导致一系列的机会性感染，机会性肿瘤，消耗性疾病等。患者会出现明显的体重下降，不明原因的发热、腹泻，口腔念珠菌感染，肺结核，肺孢子菌肺炎，隐球菌肺炎，结核性脑膜炎，隐球菌脑炎以及其他各种各样的病毒感染性的疾病，有的患者还会出现全身衰竭，甚至是死亡。艾滋病晚期，患者皮肤会出现带状疱疹，或者是单纯的疱疹。此外，口腔内还会出现溃疡，艾滋病晚期，如果病毒侵犯到神经系统，患者会出现精神失常，头痛，反应迟钝，智力迟钝，惊厥，半身不遂，痴呆等。