小便的时候，阴道里面疼痛，有可能是患有尿道炎出现的症状，也可能是因为患有阴道炎，引起阴道粘膜充血水肿或者溃疡出现的症状。需要及时去医院妇科就诊，配合医生做妇科和白带常规检查，确诊是否患有阴道炎。同时需要确诊是患了哪种病菌感染引起的阴道炎，确诊后在医生指导下，根据具体病因使用敏感抗生素阴道给药治疗。如果排除阴道炎，需要做尿常规检查，确诊是否患有尿道炎，确诊患有尿道炎后，还需要做细菌培养检查，确诊是哪种病菌感染引起的尿道炎，确诊后在医生指导下，使用敏感抗生素消炎治疗。