月经过后小肚子疼腰酸，很可能是因为盆腔炎或者宫颈炎等异常情况引起。正常情况下在月经期可能会出现轻微的腰酸腹痛，等到月经干净后这些症状都会消失，应该是正常生理性的原因。如果月经干净后还会出现这种情况，可能是因为妇科炎症引起。所以需要避开月经期间及时去医院在医生的建议下做妇科、B超白带常规等一些其他的相关检查，通过检查确定是哪种妇科炎症后，需要采取对症治疗的措施。治疗期间要注意休息，保持清洁卫生，禁止性生活。按照医生的建议，做好治疗后的定期复查。