多囊卵巢综合症和卵巢囊肿的区别，就是如果卵巢上可以看到很多很小的囊泡，而且常常是伴有月经不调、不孕症等等的情况，那就是考虑多囊卵巢综合症了。但是，卵巢囊肿一般是在卵巢表面，只有一个或者两个囊性肿物，而基本上不会看到个数更多的肿物的，这是两种完全不同的疾病。多囊卵巢综合征是属于内分泌方面的问题，是要通过内分泌调理和治疗，而主要不是靠手术治疗；卵巢囊肿有的是生理性的；有的会自动消失；有的最终只能接受手术。