咳嗽是一种神经反射的过程，大部分咳嗽刺激来自呼吸道的粘膜，有的刺激来自呼吸系统以外的器官。咳嗽的一些并发症反映咳嗽的病理生理。咳嗽可使迷走神经的反射紧张度增加，可引起心动过缓和心脏传导阻滞。咳嗽也可刺激咽喉引起恶心想吐。咳嗽引起胸膜腔内压升高时可发生气胸。也可引起胸壁，腹壁肌肉劳损，甚至肋骨断裂。咳嗽时脑血管静脉压升高，使颅内压增高，引起咳嗽性的头痛以及视网膜破裂等。