男性右腰部隐痛的原因，主要有急性肾盂肾炎、肾周围炎、肾周围脓肿、肾结石、输尿管结石、肾囊肿、肾脓肿、急性间质性肾炎、急性肾炎等，以及其他系统疾病，比如腰肌劳损、腰椎间盘突出等情况。如果出现右腰部的隐痛，建议正规医院就诊，可以完善泌尿系彩超、尿常规、24小时尿蛋白定量、血常规、血肝肾功离子、凝血系统、病毒血清血等检查，必要的时候可以行腰部CT检查，以明确诊断疾病，给予积极、合理的治疗。