真菌性毛囊炎在临床上主要是抗真菌治疗。通常情况下，根据真菌性毛囊炎的具体临床表现，可以使用一些相应的药物，主要以外用药物为主。具体如下：可以外涂复方酮康唑，二硫化硒洗剂，也可以外涂磷苯苄唑乳膏，或者是使用5%~10%的硫磺软膏治疗。患者出现的毛囊炎的炎症反应比较明显的，可以适当的配合口服一定的抗组胺药物治疗，通常情况下可以口服第二代的抗组胺药，比如盐酸西替利嗪或者是氯雷他定，也可以适当配合口服一定的中成药如防风通圣颗粒进行治疗。建议去正规医院确诊后对症治疗。