小便后小腹疼痛常见的原因是炎症刺激引起，比如有尿道炎、膀胱炎等。男性有可能是前列腺疾病，女性与子宫附件器质性病变、盆腔炎等密切相关，需要根据其他合并症状进一步检查确诊。如果有肾区疼痛、血尿，需要警惕泌尿系结石，检查泌尿系B超可以明确。如果有白带异常，由于女性阴道和尿道相邻，可能会合并有妇科炎症，比如阴道炎、宫颈炎等，检查尿常规、阴道炎五联检等，可以明确炎症情况，确诊后积极抗炎治疗。