肾脏位置疼痛的致病原因有：第一是因为肾脏患有急性肾盂肾炎引起肾脏位置疼痛，急性肾盂肾炎能够诱发和刺激肾脏包膜出现异常和水肿，引起肾脏不适和疼痛，表现出尿频、尿急、尿痛以及腰部疼痛等症状；第二是肾脏部位或输尿管部位存在结石诱发肾脏绞痛；第三是因为患有肾脏肿瘤或者肾囊肿同样会引发肾脏位置的疼痛。