排尿分叉一般是因膀胱向外排尿时，尿路出现梗阻所导致的。所以常见于下尿路的一些梗阻性的疾病，于男性患者中比较常见的是前列腺炎、前列腺增生、尿道结石、尿道异物、尿道口肿物等。有一些男性患者因包皮过长或者包茎导致阴毛卷入尿道外口处，在排尿时可因阴毛的原因，出现排尿分叉。对于女性患者来说最常见的疾病主要有尿道结石、尿道外口肿物。因为有尿道结石及尿道外口的肿物堵塞，导致尿液排出时，从梗阻的部位两侧排出，从而出现排尿分叉。