不同类型的角膜炎选用的眼药水也不相同，需要根据致病原的性质来选择。病毒性角膜炎，需要选择抗病毒的眼药水，例如干扰素眼药水，更昔洛韦或阿昔洛韦眼水。真菌性角膜炎，需要点抗真菌类的眼药水，常用的包括：两性霉素B，那他真眼药水等。细菌性角膜炎，要选择抗细菌的眼药水，常选择左氧氟沙星，妥布霉素眼药水及眼膏等。神经麻痹性角膜炎通常是干眼的一种，需要补充人工泪液和抗炎治疗。有些类型的角膜炎适当的使用激素可缓解炎症反应，但是对于真菌性角膜炎和上皮型病毒性角膜炎是禁用的。