甲状腺功能减退症确诊的指标主要是甲状腺功能，包括甲状腺激素、促甲状腺激素、甲状腺自身抗体。临床期的甲减表现为甲状腺激素水平降低，而促甲状腺激素水平升高。亚临床甲减可能仅表现为促甲状腺激素水平升高，而甲状腺激素水平是正常的。很多甲减患者还会有甲状腺自身抗体的阳性，比如过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体。很多甲减的患者还会表现为甲状腺肿大，通过甲状腺超声可以发现。甲状腺功能减退症首选的治疗办法是长期使用甲状腺激素替代治疗，这是目前最有效的治疗办法。