注射甲钴胺时有可能会引起严重的不良反应，如过敏反应，可能会引起血压下降、呼吸困难等过敏反应。在用药时应密切观察，如果出现这种副作用，应立即中止用药并采取适当的措施。注射甲钴胺后还有可能会引起皮疹，如果出现皮疹也应停止用药。注射甲钴胺后还有可能引起头痛、发烧、出汗、肌内注射部位疼痛、硬结，如果出现这些副作用也应停止用药。注射甲钴胺主要是用于治疗周围神经病以及用于治疗因缺乏维生素B12引起的巨幼红细胞性贫血。如果使用一个月后仍不见疗效，则不必继续无目的的使用。