龟头上起了小水泡，那么在临床上是比较常见的，一般考虑以下几种情况：一，常规因素：这类患者一般都有包皮过长，或者由于日常生活中清洁不到位，包皮垢堆积与龟头摩擦等因素，可以导致龟头上起小水泡，这种小水泡成非透明样，散在分布，并且疼痛感不是特别明显。二，性病可能：生殖器疱疹，这种水泡多呈现成簇分布，水泡透明，疼痛感较明显，此类患者一般有明确的不洁性交史，属于性传播疾病，患者可以先自我检查，建议到正规医院及时就诊，明确诊断后再采取治疗措施。若为包皮清洁不到位所致的可以先进行保守治疗，如调整饮食，减少刺激性食物，保持清洁等等。