可以通过以下方法判断卵巢囊肿是否是良性的：1、通过抽血检查妇科肿瘤三项，了解癌肿抗原、癌胚抗原是否出现异常增高，如果没有异常增高，基本可以确定是良性的。2、了解卵巢囊肿的生长速度，如果生长速度不快，复查的时候发现囊肿变化不大，基本可以确定是良性的。3、了解病人的具体情况，比如近期内没有出现体重的明显变化，不会出现恶病质的情况，卵巢囊肿是良性的可能性比较大。所以一旦发现卵巢有病理性囊肿，建议及时进行手术治疗，最终的诊断是将切除的囊肿送病理化验，以病理诊断为准。