左边卵巢囊肿隐隐作痛的原因如下。第一、卵巢囊肿增大，导致囊肿内压力增大，包膜紧张引起隐痛。第二、卵巢囊肿受到卵巢韧带牵拉以及受到肠道、子宫等挤压，也会引起隐痛不适。第三、如果卵巢囊肿是炎性包块，炎症导致炎性渗出液增多、引起炎性介质释放，刺激盆腔腹膜、盆底神经等也会引起。第四、如果是巧克力囊肿，是由于子宫内膜异位引起。异位内膜会在月经期会发生脱落出血，导致囊肿增大，引起胀痛。