发病原因是人毛滴虫和阴道毛滴虫形态相似，但波动膜和基本染色棒长至体后端，后鞭毛在波动膜左侧平行。当身体后端伸出体外时，很少形成伪足，在不适宜的环境中也可能形成伪囊。人体可以通过吞咽和吞噬获得营养。滋养层寄生在人体结肠内，通过纵向二分法繁殖，在室温下可存活8天，在土壤中可存活7天，因摄入被滋养层污染的食物或饮用水而引起的感染，或由苍蝇传播。人毛滴虫的发病机制可引起肠黏膜充血、水肿和炎症反应、黏膜上皮细胞坏死和脱落、淋巴滤泡脓肿形成。