乙型肝炎E抗体阳性具体如何治疗，要根据病因来决定。在乙肝系列检查中，如果仅仅是单纯乙型肝炎E抗体这一项指标阳性，需要进一步检查可能导致该指标阳性的原因：一方面有可能是之前感染过，目前处于恢复期，这种情况通常无需特殊治疗。另一方面也可能是体内有少量的乙肝病毒存在，需要进一步通过乙肝病毒DNA检查，如果有病毒存在，并且处于疾病活动期，必要时，可能需要在医生的指导下来进行抗病毒治疗，同时积极的提高自身免疫力，有助于该指标的转阴。