男的小便疼痛，应当先确定引起病因在做针对性的治疗，如果小便疼痛时还伴有尿频，尿急等症状，可能为尿路感染所引起，需要做尿常规，尿液培养等检查确诊，确定致病菌服用相应的抗生素类药物进行治疗。在治疗期间要注意生理卫生，多喝水，多排尿，饮食清淡，如果小便时还伴有腰腹部疼痛感，可能为泌尿系统结石所引起，需要做泌尿系彩超确诊确定结石的位置以及大小，如果结石较小，可服用排石颗粒促进排时，对于较大的结石，要进行体外冲击波碎石或手术取石。